L’exploration du microbiote intestinal par les outils de la métagénomique au service de la santé animale et humaine

L’essor des nouvelles technologies de séquençage de l’ADN a, depuis une décennie, bouleversé les méthodologies et ouvert de nouvelles perspectives de recherche dans de nombreux domaines. La métagénétique et la métagénomique, appliquées à la microbiologie, a permis de changer la vision du monde scientifique face à l’omniprésence des populations microbiennes dans notre quotidien. Basées sur l’exploration de la biodiversité taxonomique et fonctionnelle des bactéries, de nombreuses recherches ayant pour but le contrôle et le management des écosystèmes microbiens ont vu le jour, dans le domaine de la santé, dans l’industrie mais également dans la gestion de notre environnement. Cette revue détaille et illustre brièvement les techniques métagénomiques actuelles.