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26 January 2014
Paper published in a book (Scientific congresses and symposiums)
A hybrid human-computer approach for large-scale image-based measurements using web services and machine learning
Marée, Raphaël  ; Rollus, Loïc  ; Stevens, Benjamin  et al.
2014 • In Proceedings IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
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Keywords :
imaging informatics; machine learning
Abstract :
[en] We present a novel methodology combining web-based software development practices, machine learning, and spatial databases for computer-aided quantification of regions of interest (ROIs) in large-scale imaging data. We describe our main methodological choices, and then illustrate the benefits of the approach (workload reduction, improved precision, scalability, and traceability) on hundreds of whole-slide images of biological tissue slices in cancer research.
Research center :
Giga-Systems Biology and Chemical Biology - ULiège
Institut Montefiore
Disciplines :
Computer science
Author, co-author :
Marée, Raphaël  ;  Université de Liège - ULiège > GIGA-Management : Plateforme bioinformatique
Rollus, Loïc ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Stevens, Benjamin ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Louppe, Gilles  ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Caubo, Olivier 
Rocks, Natacha ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Biochimie et physiologie générales, humaines et path.
Bekaert, Sandrine ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Biochimie et physiologie générales, humaines et path.
Cataldo, Didier  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Biochimie et physiologie générales, humaines et path.
Wehenkel, Louis ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Language :
English
Title :
A hybrid human-computer approach for large-scale image-based measurements using web services and machine learning
Publication date :
May 2014
Event name :
11th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
Event date :
du 29 avril 2014 au 2 mai 2014
Audience :
International
Main work title :
Proceedings IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
Publisher :
IEEE
Peer reviewed :
Peer reviewed
Name of the research project :
CYTOMINE
Funders :
FEDER - Fonds Européen de Développement Régional
Service public de Wallonie : Direction générale opérationnelle de l'économie, de l'emploi et de la recherche - DG06

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