[en] Probabilistic graphical models (PGM) efficiently encode a probability distribution on a large set of
variables. While they have already had several successful applications in biology, their poor scaling in terms
of the number of variables may make them unfit to tackle problems of increasing size. Mixtures of trees
however scale well by design. Experiments on synthetic data have shown the interest of our new learning
methods for this model, and we now wish to apply them to relevant problems in bioinformatics.
Research Center/Unit :
Systèmes et Modélisation
Disciplines :
Computer science
Author, co-author :
Schnitzler, François ; Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Geurts, Pierre ; Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Wehenkel, Louis ; Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation
Language :
English
Title :
Looking for applications of mixtures of Markov trees in bioinformatics
Publication date :
21 March 2011
Number of pages :
A0
Event name :
BioMAGNet Annual Meeting 2011
Event place :
Bruxelles, Belgium
Funders :
FRIA - Fonds pour la Formation à la Recherche dans l'Industrie et dans l'Agriculture Biomagnet IUAP network of the Belgian Science Policy Office Pascal2 network of excellence of the EC