Doctoral thesis (Dissertations and theses)
Genetic evaluation of young adults with cancer
Freire Chadrina, Maria
2025
 

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Keywords :
Cancer genetics; Digenic inheritance; Oligogenic inheritance; Multiple primary cancers
Abstract :
[en] The oligogenic coinheritance of heterozygous pathogenic variants (PVs) in cancer-related genes is a poorly studied event. Currently, due to the increment of cancer survivors and the the wide-spreading of next generation sequencing (NGS) methods, the probability of presenting multiple primary cancers (MPCs) and uncommon cancer-gene associations is higher. This study included young MPCs patients and patients with single or MPCs and multiple PVs. NGS sequencing techniques of germline and tumoral DNA were used. Ten patients with MPC were included in the study and presented a mean of three cancers per patient. Whole exome sequencing (WES) of the germline DNA identified 1-3 variants possibly related to the disease in each patient, and most of them were classified as variants of uncertain significance. Additionally, six patients from five MPCs families who coinherited PVs in two cancer predisposition genes, and three patients with metastatic colorectal cancer that were heterozygous for a previously known BRCA1 nonsense variant were described. The sequencing of patients with early cancers, family history and multiple tumors is already a standard of care. However, the growing evidence suggests that patient´s assessment should not stop at the identification of one PV in a cancer predisposition gene.
[fr] La co-hérédité oligogénique de variants pathogènes (VP) hétérozygotes dans les gènes liés au cancer est un événement peu étudié. Actuellement, en raison de l’augmentation du nombre de survivants du cancer et de la large diffusion des méthodes de séquençage de nouvelle génération (NGS), la probabilité de présenter plusieurs cancers primaires (PCP) et des associations rares de gènes de cancer est plus élevée. Cette étude a inclus de jeunes patients atteints de PCP et des patients présentant un ou plusieurs PCP et plusieurs VP. Des techniques de séquençage NGS de l’ADN germinal et tumoral ont été utilisées. Dix patients atteints de PCP ont été inclus dans l’étude et présentaient en moyenne 3 cancers par patient. Le WES de l'ADN germinal a identifié 1 à 3 variants possiblement liés à la maladie chez chaque patient, et la plupart d'entre eux ont été classés comme variants de signification incertaine. De plus, six patients de cinq familles PCP qui ont co-hérité de VP dans deux gènes de prédisposition au cancer, et trois patients atteints d'un cancer colorectal métastatique qui étaient hétérozygotes pour un variant non-sens BRCA1 précédemment connu ont été décrits. Le séquençage des patients présentant des cancers précoces, des antécédents familiaux et des tumeurs multiples constitue déjà une norme de soins. Cependant, de plus en plus de preuves suggèrent que l'évaluation du patient ne devrait pas s'arrêter à l'identification d'un variant pathogène dans un gène de prédisposition au cancer.
Research Center/Unit :
GIGA-AUHG - GIGA Cancer-Human Genetics - ULiège
Disciplines :
Genetics & genetic processes
Author, co-author :
Freire Chadrina, Maria  ;  Université de Liège - ULiège > GIGA
Language :
English
Title :
Genetic evaluation of young adults with cancer
Defense date :
11 February 2025
Institution :
ULiège - Université de Liège [Medicine], Liege, Belgium
Degree :
Doctorate in Medical Sciences
Promotor :
Bours, Vincent ;  Université de Liège - ULiège > GIGA > GIGA Cancer - Human Genetics
President :
Struman, Ingrid  ;  Université de Liège - ULiège > GIGA > GIGA Cancer - Molecular Angiogenesis
Secretary :
Freres, Pierre ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences cliniques
Jury member :
Habraken, Yvette ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences de la vie > Génétique et biologie moléculaires animales
Sautois, Brieuc  ;  Université de Liège - ULiège > Département de pharmacie
Claes, Kathleen;  UGent - Ghent University > Department of Biomolecular Medicine
Ligtenberg, Marjolijn;  Ziekenhuisgroep Twente > Department of Medical Oncology
Funders :
Télévie
Région wallonne
CHU Liège - Central University Hospital of Liege
Funding number :
7451419F; 1710180; 981481200
Available on ORBi :
since 12 February 2025

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