Le projet GROOT (GROuping research On Tree-rings database) : sauvegarder, partager et valoriser les données dendrochronologiques

L’atelier GROOT au sein de l’actuel FRA Bioarchéodat (ancient GDR Bioarcheodat) a pour objectif de fédérer les dendrochronologues francophones afin de sauvegarder, partager et valoriser les données dendrochronologiques, mais aussi de créer de nouveaux outils de recherche collaboratifs. De prime abord, ces outils prennent la forme d’une base de données et d’un logiciel de datation. Leur mise en place se fait progressivement avec des échanges réguliers afin de s’assurer la compatibilité des outils. La base de données sera déployée en ligne sous le nom de “Deep in Heritage”. Les métadonnées dendrochronologiques (site, lieux, type de construction, dates d’abattage, lien bibliographique, etc.) seront facilement accessibles à tous les visiteurs. La pérennité, l’échange et l’accès à des données dendrochronologiques sécurisées est un enjeu pour la communauté scientifique. Dans cette optique, cette base de données, développée et hébergée dans un premier temps en Belgique, sera ainsi disponible en ligne fin 2025. Pour les utilisateurs connectés, elle permettra de déposer des données, d’effectuer des requêtes sur des données spatialisées et contextualisées. Le téléchargement des données se fera en fonction des accès permis par les laboratoires partenaires. En outre, cette plateforme assurera également la conservation des largeurs de cernes (données brutes), des métadonnées, mais aussi des rapports d’expertise ad hoc.
En parallèle, un nouveau logiciel également déployable en ligne pour la datation est en phase de test depuis l’automne 2024, après un an de développement à l’Université du Mans. Ce logiciel, « pyDendron », est une fusion de Sylphe et de Dendron-IV, deux anciens logiciels développés au laboratoire Chrono-environnement (CNRS, Besançon). L’objectif à court terme est de pérenniser et d’améliorer des outils vieillissants (plus de 25 ans pour Sylphe), mais indispensables au quotidien pour la majorité des dendrochronologues francophones. En proposant un logiciel open source et gratuit, nous espérons faciliter ainsi les échanges.
À terme, l’objectif est de développer une interface ouverte pour interconnecter directement “ Deep In Heritage “ aux logiciels de datation. Cette interface proposera un écosystème cohérent, favorisant l’amélioration des capacités analytiques en dendrochronologie, le partage des données et leur visibilité.
Enfin, l’atelier GROOT s’efforce aussi de trouver des solutions pérennes pour conserver et centraliser non seulement les largeurs de cernes, mais aussi l’ensemble de la documentation produite (rapports d’analyse, scans des échantillons, etc.) jusqu’à la traçabilité des sections ou des carottes dendrochronologiques. Il convient donc de présenter les solutions actuelles à plus ou moins long terme (dendrothèque Région PACA) et d’envisager des solutions plus durables pour le futur. Ces efforts visent à garantir que ces « témoins bioarchéologiques » puissent non seulement être réanalysés avec des techniques émergentes en dendrochonologie (ADN, Isotopes, etc.), mais aussi avec celles à venir.