Investigation du cycle biologique de l'herpèsvirus murin 4 par des approches protéomiques et par l'interférence à ARN

Les nombreuses pathologies dont sont responsables les membres de la sous-famille des Gammaherpesvirinae et le nombre réduit de stratégies prophylactiques ou thérapeutiques actuellement sur le marché justifient une meilleure compréhension du cycle biologique de ces virus. Dans ce travail, nous avons utilisé deux techniques de screening à haut débit en vue de développer les connaissances relatives au cycle de l'herpèsvirus murin 4, utilisé comme modèle pour d'autres virus tels que l'EBV ou le KSHV. D'une part, à l'aide d'un screening whole genome utilisant l'interférence à ARN, nous avons pu dresser une liste de 65 gènes cellulaires dont les produits d'expression favorisent l'infection virale (proviral genes) et de 110 gènes cellulaires limitant potentiellement l'infection (antiviral genes). Dans un avenir proche, la validation de ces cibles pourrait nous permettre de mieux comprendre la biologie de ces infections et de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques ou prophylactiques. Par ailleurs, la réalisation de ce screening et l'analyse des résultats générés auront permis l'acquisition d'un savoir-faire qui pourra être mis à profit par le laboratoire d'accueil dans le cadre d'autres projets de recherche. Dans la deuxième partie de ce travail, nous avons analysé la composition des particules virales extracellulaires de MuHV-4. Cette étude, qui faisait suite à plusieurs études du même type sur d'autre Gammaherpesvirinae, nous a permis d'améliorer très significativement notre connaissance de la composition des virions de MuHV-4 en particulier et des Gammaherpesvirinae en général. En effet, les résultats générés par ce type d'étude est souvent tributaire de la qualité de préparation des échantillons et de grandes variations existaient entre les données publiées. Par ailleurs, le développement des techniques de spectrométrie de masse améliore constamment la qualité des résultats générés. Sur base des études préalables sur le sujet, nous avons pu développer un protocole expérimental qui nous a permis d'identifier 31 protéines de structure encodées par le génome du MuHV-4 dont nous avons déterminé l'abondance relative. Par ailleurs, différentes protéines cellulaires ont également pu être identifiées, bien que celles-ci soient proportionnellement moins abondantes. Ces données nous ont permis de dresser une comparaison des différents protéomes structuraux des Gammaherpesvirinae et d'en identifier les protéines communes. Dans le futur, l'ensemble de ces résultats devraient nous permettre de mieux comprendre le cycle biologique de ces virus et de développer de nouveaux projets de recherche fondamentale et/ou appliquée.