Abstract :
[en] The diverse physiography of the Portuguese land and marine territory, spanning from continental Europe to the Atlantic archipelagos, has made it an important repository of biodiversity throughout the Pleistocene glacial cycles, leading to a remarkable diversity of species and ecosystems. This rich biodiversity is under threat from anthropogenic drivers, such as climate change, invasive species, land use changes, overexploitation or pathogen (re)emergence. The inventory, characterization and study of biodiversity at inter- and intra-specific levels using genomics is crucial to promote its preservation and recovery by informing biodiversity conservation policies, management measures and research. The participation of researchers from Portuguese institutions in the European Reference Genome Atlas (ERGA) initiative, and its pilot effort to generate reference genomes for European biodiversity, has reinforced the establishment of Biogenome Portugal. This nascent institutional network will connect the national community of researchers in genomics. Here, we describe the Portuguese contribution to ERGA’s pilot effort, which will generate high-quality reference genomes of six species from Portugal that are endemic, iconic and/or endangered, and include plants, insects and vertebrates (fish, birds and mammals) from mainland Portugal or the Azores islands. In addition, we outline the objectives of Biogenome Portugal, which aims to (i) promote scientific collaboration, (ii) contribute to advanced training, (iii) stimulate the participation of institutions and researchers based in Portugal in international biodiversity genomics initiatives, and (iv) contribute to the transfer of knowledge to stakeholders and engaging the public to preserve biodiversity. This initiative will strengthen biodiversity genomics research in Portugal and fuel the genomic inventory of Portuguese eukaryotic species. Such efforts will be critical to the conservation of the country’s rich biodiversity and will contribute to ERGA’s goal of generating reference genomes for European species.
[pt] A diversa fisiografia dos territórios terrestre e marinho portugueses, que se estende desde a Europa continental até aos arquipélagos do Atlântico, promoveu a sua importância como repositório de biodiversidade ao longo dos ciclos glaciares do Pleistoceno, resultando numa notável diversidade de espécies e ecossistemas. No entanto, esta biodiversidade enfrenta ameaças decorrentes de atividades humanas, tais como as alterações climáticas, invasão de espécies, mudanças no uso do solo, exploração excessiva e (re)emergência de agentes patogénicos. A fim de promover a preservação e recuperação da biodiversidade, é crucial inventariar, caracterizar e estudar a biodiversidade a níveis inter e intraespecíficos, utilizando técnicas genómicas. Essa informação é essencial para informar políticas de conservação da biodiversidade, medidas de gestão e pesquisas futuras. A participação de investigadores de instituições portuguesas na iniciativa European Reference Genome Atlas (ERGA), e no projeto-piloto para gerar genomas de referência para a biodiversidade europeia, promoveu a criação do Biogenoma Portugal. Esta rede institucional em desenvolvimento visa conectar a comunidade nacional de investigadores em genómica.
Neste contexto, descrevemos a contribuição portuguesa para o projeto-piloto do ERGA, que tem como objetivo gerar genomas de referência de alta qualidade de seis espécies de
Portugal. Estas espécies são endémicas, icónicas e/ou ameaçadas e incluem plantas,
insetos e vertebrados (peixes, aves e mamíferos) do território continental de Portugal e das ilhas dos Açores. Adicionalmente, delineamos os objetivos do Biogenoma Portugal que visa:
(i) promover a colaboração científica, (ii) contribuir para a formação avançada, (iii) estimular
a participação de instituições e investigadores baseados em Portugal em iniciativas
internacionais de genómica da biodiversidade e (iv) contribuir para a transferência de
conhecimento e envolvimento do público em geral na preservação da biodiversidade. Esta
iniciativa fortalecerá a investigação em genómica da biodiversidade em Portugal e
contribuirá para o objetivo do ERGA de gerar genomas de referência para espécies
europeias. Estes esforços terão um papel fundamental na conservação da biodiversidade
do país e na promoção da conscientização sobre a importância de preservar a diversidade
biológica.
