Introduction à la phylogénie moléculaire à l’usage des malacologues amateurs

Le malacologue amateur est souvent intéressé par comprendre le lien qui existe entre les espèces, et c’est d’autant plus vrai si celui possède des collections de coquilles, que ce soit pour raisons scientifiques ou simplement pour le plaisir. On peut même caricaturer certaines situations rencontrées par le collectionneur : un changement de taxonomie peut induire un petit traumatisme car il implique éventuellement une correction des étiquettes de la collection. Une modification de l’ordre faussement établi des familles par la création de nouvelles familles, voire transfert d’espèces d’une famille à une autre, et c’est le drame. Le collectionneur soigneux, ayant un tiroir par famille se retrouve à devoir changer toutes la structure de sa collection, voire de meuble. Le malacologue se retrouve alors fatalement à s’intéresser à pourquoi telle espèce est rapprochée d’une autre, et pourquoi il y a régulièrement des remises en questions voire des modifications dans les classifications. La faute vient des scientifiques qui ne se contentent pas que de classer les êtres vivants ; ces derniers veulent en plus que cette classification traduise l’histoire évolutive des espèces. Hors l’état de leur connaissance progresse en permanence, et les modifications régulières dans les classifications trahissent ce travail perpétuel de reconstitution. Pour le malacologue amateur qui veut en savoir plus, celui-ci se retrouve rapidement né à né avec des articles scientifiques présentant des arbres phylogénétiques. N’ayant pas toujours reçu une formation de génétique, et qui plus est, récente car il s’agit d’un domaine en constant progrès, il est facile à imaginer que ce malacologue soit un peu perdu face à ces d’arbres. L’aider à comprendre les bases de cette discipline qu’est la phylogénie moléculaire est l’objectif de cet article.