Master’s dissertation (Dissertations and theses)
Du pigment photosynthétique à la reconstruction de l’état trophique par imagerie hyperspectrale et d’une approche multisite
Auboiron, Jeanne
2021
 

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Keywords :
Holocène; pigments algaux et bactériens; imagerie hyperspectrale; eutrophisation; multi-sites; Holocene; algal and bacterial pigments; hyperspectral imaging; eutrophication; multi-site
Abstract :
[fr] Les évaluations de la paléoproduction aquatique et la préservation des pigments nécessitent une identification précise et la quantification des chlorophylles et bactériochlorophylles sédimentaires. L'utilisation de techniques chromatographiques pour analyser de longs enregistrements à haute résolution n'est pas pratique puisqu'elles sont coûteuses et peu précis pour les bactériochloropigments. Une nouvelle approche est développée dans cette étude a multisite, elle est plus rapide et peu coûteuse pour déduire de multiple pigments algaux et bactériens à partir de la décomposition par gaussiennes des spectres d'absorption (GSDP) dans le visible et le proche infra-rouge mesurés par l'imagerie hyperspectrale. Cette méthode GSDP a été validée en comparaison avec l’indice de profondeur d’absorption relative (RABD) et la région de bande d'absorption relative (RABA) sur des sédiments représentant la diversité environnementale. Par la méthode GSDP la semi-quantification des pigments photosynthétiques est possible. Les résultats obtenus montrent que les effets de matrice et de surfaces ont un impact important pour les méthodes RABD et RABA. La nouvelle méthode a été ajustée après un test de répétabilité sur les 20 sites d'études. Les profils obtenus à partir de cette méthode sont validés lors de la comparaison avec les événements d'eutrophisation cités dans la littérature et la présence de chlorophylle et bactériochlorophylle. La nouvelle méthode est utile pour obtenir, d'une manière efficace des informations sur les principaux groupes de pigments qui sont pertinents pour déduire la paléoproduction, potentiellement le type de biomasse d'algues et de bactéries. En complément, cette méthode de déconvolution spectrale pourrait être affinée afin d'obtenir d'autres pigments photosynthètiques.
[en] Assessments of aquatic paleoproduction and pigment preservation require accurate identification and quantification of sedimentary chlorophylls and bacteriochlorophylls. The use of chromatographic techniques to analyze long records at high resolution is impractical since they are expensive and not very accurate for bacteriochloropigments. A new approach is developed in this multisite study that is faster and cheaper to deduce multiple algal and bacterial pigments from Gaussian decomposition of visible and near infrared absorption spectra (GSDP) measured by hyperspectral imaging. This GSDP method has been validated in comparison with the relative absorption depth index (RABD) and relative absorption band area (RABA) on sediments representing environmental diversity. By the GSDP method the semi-quantification of photosynthetic pigments is possible. The results obtained show the important matrix and surface effects for the RABD and RABA methods. The new method was adjusted after a repeatability test on the 20 study sites. The profiles obtained from this method are validated when compared with the eutrophication events cited in the literature and the presence of chlorophyll and bacteriochlorophyll. The new method is useful to obtain, in an efficient way, information on the main pigment groups that are relevant to infer paleoproduction, potentially the type of algal and bacterial biomass. In addition, this spectral deconvolution method could be refined to obtain other photosynthetic pigments.
Research center :
Laboratoire Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C, UMR6143, CNRS)
Disciplines :
Earth sciences & physical geography
Author, co-author :
Auboiron, Jeanne ;  Université de Liège - ULiège > GEOLOGY
Language :
French
Title :
Du pigment photosynthétique à la reconstruction de l’état trophique par imagerie hyperspectrale et d’une approche multisite
Alternative titles :
[en] The photosynthetic pigment to the reconstruction of the trophic state by hyperspectral imaging and a multisite approach
Defense date :
17 June 2021
Number of pages :
63+43
Institution :
Université de Rouen, Rouen, France
Degree :
Master 2 en gestion de l'environnement et des hydrogéosystémes
Promotor :
Debret, Maxime
Jacq, Kevin
President :
Le Bot, Sophie
Jury member :
Copard, Yoann
Available on ORBi :
since 10 December 2021

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