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Nets versus trees for feature ranking and gene network inference
Vecoven, Nicolas; Begon, Jean-Michel; Huynh-Thu, Vân Anh et al.
2017
 

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Nets_versus_trees_for_feature_ranking_and_gene_network_inference.pdf
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Keywords :
feature selection; deep learning
Abstract :
[en] We propose to tackle the challenging problem of gene regulatory network inference, using variable importance measures derived from artifi cial neural networks (ANN). When combined with a L1-regularized selection layer, these measures allow ANN to be competitive with state of the art techniques for this problem based on random forests.
Disciplines :
Computer science
Author, co-author :
Vecoven, Nicolas ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Big Data
Begon, Jean-Michel ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Algorith. des syst. en interaction avec le monde physique
Huynh-Thu, Vân Anh  ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Algorith. des syst. en interaction avec le monde physique
Geurts, Pierre  ;  Université de Liège - ULiège > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Algorith. des syst. en interaction avec le monde physique
Language :
English
Title :
Nets versus trees for feature ranking and gene network inference
Publication date :
17 December 2017
Available on ORBi :
since 17 January 2019

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